داستان فیلم روایتگر داستان ماجراهای عجیب یک پدر است که به نوعی خود را دانشمند فرض می‌کند. او مدعی شده که قرص‌هایی برای رشد و فعالیت سریع کودکان اختراع کرده است. داستان از جایی آغاز میشود که دو دزد بچه هایی را می‌ربایند و این قرصهای معجزه گر باعت ایجاد اتفاقاتی جذاب و بامزه در فیلم میشوند.

داستان فیلم دزد و پری 1 درباره پیرمرد نظامی بازنشسته ای به اسم آقای ابطحی است که به درخواست دخترش نوشین که در شرایط اضطرار قرار گرفته اداره مهدکودکش را برای یک روز قبول می‌کند. بچه‌های مهد که تصور می‌کنند جایگزین مربی دوست داشتنی شان شده و او را در مخمصه‌هایی می‌اندازند که ناگهان ...