داستان فیلم نهنگ عنبر 2 درباره زنی به اسم نسرین است که از شوهرش می گیرد ولی نمی تواند دختر شش ساله‌اش را از شوهرش بگیرد زندگی اش را جمع می کند و بی اطلاع شوهر به گوشه ای از شهر پناه می برد.

داستان فیلم درباره مردی 50 ساله به اسم ارژنگ صنوبر است که در زندگی اجتماعی خود دچار مشکل شده است. او سخت عاشق دختری به اسم رویا می شود. او که از کودکی رویا را دوست داشته، به دلایلی نمی تواند با او ازدواج کند و رویا با توجه به محدودیت های اجتماعی دهه شصت، به همراه خانواده اش راهی آمریکا می شود.